Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF21BQ96EK2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms