Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAVIN3Q969G5 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAVIN3Q969G5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms