Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
USP13Q92995 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP13Q92995 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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