Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRG4Q92954 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRG4Q92954 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms