Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ZNF516Q92618 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF516Q92618 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms