Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APOBEC4Q8WW27 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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