Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF439Q8NDP4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF439Q8NDP4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF439Q8NDP4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF439Q8NDP4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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ZNF439Q8NDP4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ZNF439Q8NDP4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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