Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TTC29Q8NA56 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms