Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
LINC00269Q8N2A0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
LINC00269Q8N2A0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms