Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALYREFQ86V81 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms