Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms