Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LETMD1Q6P1Q0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms