Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP170Q5SW79 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CEP170Q5SW79 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms