Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP21-3Q3LHN1 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010551.3-201ENST00000563772 463 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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