Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

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Length 1,214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NBPF1Q3BBV0 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBPF1Q3BBV0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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