Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

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Length 735 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RFX4Q33E94 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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RFX4Q33E94 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RFX4Q33E94 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RFX4Q33E94 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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