Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPHKAPQ2M3C7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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