Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CSPP1Q1MSJ5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CSPP1Q1MSJ5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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