Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL24A1Q17RW2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms