Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SNAPC1Q16533 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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