Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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SSX1Q16384 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SSX1Q16384 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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