Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC85BQ15834 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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