Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SS18Q15532 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms