Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms