Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PUM3Q15397 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PUM3Q15397 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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