Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SMCO1Q147U7 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMCO1Q147U7 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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