Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRIM25Q14258 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms