Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTTNQ14247 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTTNQ14247 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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