Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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GTF2H2Q13888 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2H2Q13888 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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