Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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CUL3Q13618 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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