Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMAD4Q13485 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms