Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
SNTB2Q13425 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SNTB2Q13425 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms