Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CLN3Q13286 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CLN3Q13286 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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