Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
COX10Q12887 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
COX10Q12887 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms