Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KIF5AQ12840 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms