Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SRSF4Q08170 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms