Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PAX8Q06710 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PAX8Q06710 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms