Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNG1Q06432 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms