Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CREMQ03060 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CREMQ03060 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms