Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SPIBQ01892 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms