Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
XPCQ01831 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
XPCQ01831 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
XPCQ01831 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
XPCQ01831 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms