Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
IFITM3Q01628 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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