Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK16Q00536 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms