Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00313P59037 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms