Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP107P57740 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP107P57740 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP107P57740 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms