Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPN5P54829 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms