Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PGGT1BP53609 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP53609 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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