Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMARCA2P51531 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms