Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSNK1EP49674 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK1EP49674 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms