Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTAP49354 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms